09 enero, 2010

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Beds are burning

Desde algunos meses antes de la COP15, la gente comenzó a unirse, no sólo aquellos que antes eran conocidos como “ecologistas” sino incluso incluso los artistas en una nueva moda verde. A pesar de que las negociaciones no fueron satisfactorias, muchos siguen luchando para combatir el cambio climático, como Conservation International, más conocido como CI. Aquí les dejamos unos videos hechos para la reunión de diciembre en Copenhague. El primero es de distintos artistas internacionales y el segundo fue hecho por artistas peruanos. Con gran sinceridad, les digo que este último video sobrepasó mis expectativas, está muy muy bueno.

 

Si te interesa el tema ambiental, aquí está el enlace para que puedas descargar libremente “The Little REDD Book”. Es una guía de propuestas para reducir las emisiones de la deforestación. Es esta página hay enlaces para descargar el libro en distintos idiomas, incluyendo español.

http://www.theredddesk.org

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Viaje a través de la señalización celular

Una espectacular animación de como se da la respuesta hacia un determinado estímulo. Ya sea que nos preparemos para una pelea o para huir, la señalización celular y los cambios fisiológicos son casi los mismos. Esta animación nos lleva a través del nervio óptico, pasando por el cerebro, luego viajando por el torrente sanguíneo transportando determinadas moléculas señalizadoras, para llegar a los músculos, glándulas sudoríparas, pulmones, corazón etc… Vale la pena tomarse 4 minutos para verlo.

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Vía Utah Univesity.

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06 enero, 2010

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Atracción animal

Aunque ustedes no lo crean, todas las quejas que hay durante el apareamiento humano es un patrón que se reproduce en todo el reino animal. Por ejemplo… las tortugas son animales lentos, pero para otras cosas son muy rápidos según la queja de la señora tortuga; o en una pareja de perritos, la queja viene por ser por la única pose que sabe Rufo; para más detalles vean este video…

    

Vía College Humor.

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Visión de Rayos X

Cuantos no han soñado con tener visión de rayos X. Cuantos beneficios tendría en el campo de la medicina, los médicos podrían ver daños ocultos, huesos fracturados, pequeños tumores en lugares muy escondidos, parásitos y otros bichos que causan mucho daño a nuestro organismo. Lo mismo para los bomberos, quienes con solo observar podrían ubicar a personas atrapadas por el fuego y no perder el tiempo buscándolas entre todo el humo. Pero, estas son solo utopías, lo que en realidad pasaría sería lo siguiente…

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Vía SMBC-Comics. (Con un ligero cambio)

05 enero, 2010

Año Internacional de la Biodiversidad

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Como todos los años, la ONU y la UNESCO dan un nombre a cada año, para que permita promover grandes avances en ese campo. Ya recordamos que el 2008 fue el Año Internacional de la Papa, el año pasado fue el Año Internacional de la Astronomía. Este año fue declarado como el Año Internacional de la Biodiversidad, la cual celebrará la vida en la tierra y el valor de la diversidad biológica en nuestras vidas.

Mensaje de bienvenida del Secretario General de la ONU para el Año Internacional de la Diversidad Biológica 2010 from CBD on Vimeo.

Los hombres, aunque no nos demos cuenta, formamos parte de esta biodiversidad con la capacidad de protegerla y destruirla. Últimamente, nos hemos empecinado en hacer todo por destruirla, estamos poniendo en riesgo zonas de vida muy ricas en una gran variedad de especies de animales y plantas sólo con el fin de ampliar nuestras fuentes de energía para el futuro. Espero que este año sirva para reflexionar y empezar a cambiar nuestra manera de ver el mundo.

He aquí un reto. Te proponemos a que conozcas cada día por su “nombre propio” (nombre científico) a una de las especies que habitan nuestro planeta. En total serán 365 especies, tal como se llama esta iniciativa: http://www.365especies.com/

Otra iniciativa que surgió con la declaración de este año fue el proyecto Cuenta Atrás 2010. La Cuenta Atrás 2010 es una red activa de miembros que trabaja por lograr el Objetivo 2010 de la CDB sobre pérdida de biodiversidad. www.countdown2010.net

 

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04 enero, 2010

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Buen pretexto para llevar dulces a tu clase

Primero, empezamos con lo básico, con los elementos químicos, que combinados unos con otros generan toda la materia que existe en el universo. Cada uno de los elementos químicos cumple un papel importante en nuestro planeta, desde aleaciones que han permitido crear las estructuras más fascinantes del mundo, hasta otros que han permitido el desarrollo de la vida como lo conocemos, así que haremos una tabla periódica usando gomitas de ositos…

Ahora, es tiempo de coger las gomitas en forma de lombrices y disponerlo en forma de un cariotipo. Lo asombroso de estas gomitas es que el cariotipo que hemos diseñado pareciera como si hubiera sido teñido con la técnica de FISH (Hibridación Fluorescente In Situ). Podemos jugar con nuestro cariotipo poniendo un cromosoma más en el par 21 (Síndrome de Down), o un solo cromosoma X (Síndrome de Turner), o muchos cromosomas Y (Síndrome de Klinefelter) y otras anomalías cromosómicas más.

Y luego, estos cromosomas, ponerlos en el único momento del ciclo celular donde obtienen esta forma característica… en la división celular.

Así que pongámonos a hacer biología con cualquier cosa que tengamos a la mano, es una buena manera de divertirse… para un biólogo.

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02 enero, 2010

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El demonio de Tasmania bajo amenaza

Quien no conoce a nuestro buen amigo Taz?, aquel animal rechoncho, gritón y bastante renegón, que come cualquier cosa y al escuchar cualquier tipo de música lo pone muy mansito. Lamentablemente, su especie (Sarcophilus harrisii) viene siendo amenazada por la enfermedad del tumor facial de los demonios (DFTD). Fue por primera vez reportado en 1996 y está implicado directamente con el colapso de la población de los demonios de Tasmania, tanto así que lo puede llevar a la extinción dentro de 25 o 35 años.

Esta enfermedad se caracteriza por generar grandes tumores, principalmente en la cara y la boca, que luego hace metástasis hacia los órganos internos provocando la muerte del animal.

ResearchBlogging.orgLa DFTD es una enfermedad un poco extraña, ya que es un cáncer contagioso. Este tumor puede ser transmitido a otro demonio a través de una simple mordedura, y como los demonios son bastante agresivos entre sí, es rápida la propagación de esta enfermedad. En otras palabras, es una célula somática parásita. La DFTD aparece primero como una neoplasia, que es un pequeño tejido indiferenciado compuesto por células fusiformes con pocas características estructurales definidas.

Al secuenciar un fragmento de 1180pb de la región controladora de locus mitocondrial (LCR) del tumor, de demonios infectados y no infectados, se observó el mismo haplotipo (son genéticamente idénticos) lo que sugiere que DFTD tiene un origen clonal (un solo tipo de célula que se divide incontrolablemente).

Luego se hizo un estudio de microARNs (miRNA), que son pequeños fragmentos de ARN que ayudan a regular la actividad de los genes. Se tomaron 10 tejidos diferentes del demonio de Tasmania y 5 DFTD para hacerle el estudio de expresión de miRNA. Se identificaron 114 miRNAs que mostraban patrones de expresión específicos por cada tipo de tejido (Fig 1). Al hacer el agrupamiento usando el coeficiente de correlación de Pearson se observó que el perfil de expresión de miRNAs de los tumores estaba altamente relacionado con el perfil de expresión de las células del cerebro.

dftd Fig 1. Perfil de expresión de miRNAs de DFTD. Este heat map ha sido normalizado para 114 miRNAs clonados y secuenciados a partir de 10 tejidos del demonio de Tasmania, 4 DFTD faciales (DFTD 1, 2, 3 y20) y un DFTD que hizo metástasis a las células mamarias (DFTD2,met)

Como ya se sabía que tanto las células de los tumores como de los otros tejidos del animal eran genéticamente idénticas, se quería saber que era lo que provocaba la neoplasia, que genes se expresaban en los tumores y no en los demás tejidos y viceversa. Para esto se hizo un estudio transcriptómico. Se secuenció el transcriptoma de la DFTD y de las células de los testículos (escogido porque expresa una gran variedad de genes) dando como resultado 13665 y 16438 transcriptos únicos, respectivamente. De todos ellos, 20 eran altamente expresados en los tumores (>2.5 veces más que en los testículos), siendo el gen que codifica para la proteína básica de la mielina (MPB) el que más se expresaba; y de estos 20, 9 transcriptos estaban relacionados con la mielinización.

La mielina es una sustancia que recubre los axones de los nervios y es producida por los oligodendrocitos en el sistema nervioso central y por las células de Schwann en el sistema nervioso periférico. Según estos resultados, la DFTD tenía un comportamiento similar a uno de estos dos tipos de células. Al analizar el resto de transcriptos presentes en los tumores se encontraron que también se expresaban factores de transcripción que controlan la diferenciación de las células de Schwann y genes estructurales de la mielina.

Luego se hizo un análisis semicuantitativo de la expresión de los transcriptos altamente expresados en los tumores y no en los testículos y se comparó con la expresión en otros tejidos, incluyendo los del sistema nervioso periférico, y se observó una alta relación de estos con los DFTD. Los tumores se comportaban como células de Schwann. Para confirmar si las DFTD en verdad expresaban las proteínas de mielina, se marcaron los tumores con un anticuerpo específico llamado periaxina (PRX). Esta prueba demostró que todas las DFTD reaccionaban ante la presencia de PRX, mientras que las células sanas no lo hacían. Esta especificidad puso a la PRX como el indicador adecuado para diagnosticar la enfermedad.

Para terminar, es bastante raro que un tumor citológicamente indiferenciado exprese marcadores altamente diferenciados como de las células de Schwann. Es posible que estos genes se hayan activado después de la transformación carcinogénica. Entender como evolucionó este tipo de tumor y que lo hizo transmisible es de vital importancia para salvar a esta especie. Por lo menos ya se tiene un avance en cuanto al diagnóstico.

Murchison, E., Tovar, C., Hsu, A., Bender, H., Kheradpour, P., Rebbeck, C., Obendorf, D., Conlan, C., Bahlo, M., Blizzard, C., Pyecroft, S., Kreiss, A., Kellis, M., Stark, A., Harkins, T., Graves, J., Woods, G., Hannon, G., & Papenfuss, A. (2009). The Tasmanian Devil Transcriptome Reveals Schwann Cell Origins of a Clonally Transmissible Cancer Science, 327 (5961), 84-87 DOI: 10.1126/science.1180616

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