08 noviembre, 2010

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Zoológico de partículas

Ya habíamos visto hace algún tiempo unos adorables muñecos inspirados en algunas de las bacterias más patogénicas del hombre, pero para aquellos que aman la física, sobre todo la física de partículas, aquí una galería de muñecos para que los escojan…

Antes de pasar a los muñecos, un poco de conceptos básicos de las partículas elementales de lo que está conformado todo lo que conocemos. Para muchos, la partícula elemental más pequeña es el átomo; sin embargo, los átomos están conformados por protones y neutrones, que son más pequeños. Pero, tanto los protones como los neutrones están formados por quarks que pueden ser de seis tipos diferentes, y dependiendo de sus combinaciones, tendremos un protón o un neutrón. Los electrones pertenecen a la familia de partículas elementales llamadas fermiones, junto al muón, al tau y tres neutrinos asociados a ellos. Los quarks y los fermiones son los constituyentes fundamentales de la materia.

 

La otra familia de partículas elementales son los bosones, entre ellos tenemos a los que portan las fuerzas elementales de la naturaleza: los bosones W y Z (interacciones débiles), gluones (interacciones fuertes), los fotones (fuerza electromagnética) y el teórico gravitón (fuerza gravitatoria). A pesar de ser partículas elementales, ninguno de estos bosones tienen masa. Entonces, ¿quien da la masa a la materia? Es aquí donde entra el bosón de Higgs, que hasta ahora sigue siendo una partícula elemental teórica, tal como la materia oscura.

… Ahora sí, los muñecos:

Pero, no sólo tenemos muñecos de las partículas que conforman la materia, también tenemos sus respectivas antipartículas, sus gemelas malvadas, las cuales conforman la intrigante antimateria…

Si bien la antimateria suena mucho a ciencia ficción, la podemos son muy comunes en la naturaleza, especialmente los positrones y antineutrinos, los cuales son formado por el decaimiento radiactivo (β positivo y β negativo). Por ejemplo, las nuevas técnicas de tomografía computarizada usan los positrones para formar imágenes detalladas de nuestros órganos y detectar problemas funcionales y cánceres.

Cuál es su precio? Desde $10 para arriba, dependiendo del tamaño y el modelo

Visiten: http://www.particlezoo.net/

07 noviembre, 2010

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Plan estratégico para conservar la Biodiversidad 2011-2020

Por Prof. Norberto Ovando*

Concluyó en Nagoya (Japón) la reunión de la décima Conferencia de las Partes (COP-10) del Convenio sobre la Diversidad Biológica de Naciones Unidas, sin definir una fecha concreta para detener la pérdida de biodiversidad.

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Pérdida de Biodiversidad

El importe anual de la pérdida global de los servicios que nos ofrece la biodiversidad equivale a 50.000 millones de euros.

Unos 3.000 millones de personas dependen del mar y sus costas, 1.600 millones de los bosques y 1.000 millones de los humedales, lo que supone más del 70 % de la población mundial.

Se esperaba que nuestros gobiernos ya hubieran alcanzado una reducción significativa de la tasa de pérdida de la biodiversidad, pero una vez más han vuelto a fracasar, sucumbiendo demasiado a menudo al poder de los intereses comerciales cada vez que han tenido que elegir entre favorecer los beneficios de unos pocos o la protección de determinadas especies.

Pensar en frenar la pérdida de biodiversidad mundial es algo muy difícil, para tener algún logro se deberían combinar, la creación de nuevas grandes áreas protegidas y dar un viraje hacia una producción y un consumo sostenibles. Pero realizando estas acciones, sólo podremos reducir la proporción de pérdida de biodiversidad, pero no detenerla.

Acuerdos

Se llegó a un nuevo acuerdo para frenar la desaparición de la naturaleza que sostiene la vida humana. Los 20 objetivos estratégicos acordados para el 2020 y conocidos colectivamente como "Objetivos de Aichi", fue firmado por 190 estados miembro del Convenio sobre la Diversidad Biológica, el mismo incluye un compromiso para reducir a la mitad la proporción de pérdida de especies para 2020.

También se logró aprobar, a pesar del desacuerdo de algunos países y la ausencia de EE.UU., un acuerdo general no vinculante que protegerá el 17% de las áreas terrestres y el 10% de las áreas marinas para el periodo 2011-2020.

Chantal Jouanno, a cargo de la cartera francesa de Medio Ambiente dijo que, "Pensar en resolver el problema de la pérdida de biodiversidad sólo con fondos públicos es una ilusión", las empresas privadas deben contribuir y esto es algo lógico, porque obtienen ganancias aprovechando los recursos de la biodiversidad".

La gran pregunta es si las metas acordadas en Nagoya son lo suficientemente específicas para alterar lo que para muchos es la gran tragedia: la pérdida de biodiversidad a un ritmo mil veces superior al considerado natural. Al menos un quinto de las especies del planeta están amenazadas de desaparecer.

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Logros

Se aprobaron 30 documentos sobre la conservación de la diversidad biológica de las montañas, de las aguas continentales, y de las tierras áridas y subhúmedas.

A pesar del desacuerdo de algunos países y la ausencia de EE.UU., se logró un acuerdo general no vinculante que protegerá el 17% de las áreas terrestres y el 10% de las áreas marinas para el periodo 2011-2020.

Entre los acuerdos, se destaca la aprobación del Protocolo sobre el Acceso y el Reparto de los Beneficios derivados de los Recursos Genéticos, cuyo principal objetivo es lograr que las ganancias generadas por las empresas de insumos farmacéuticos, cosméticos y otras, procedentes de los países megadiversos, sean compartidas con estos.

2020 y 2050

En el Plan Estratégico 2020-2050 que se debatió en Nagoya (Japón) durante la Cumbre de Biodiversidad, se puede leer: “Para 2050, la diversidad biológica se valora, conserva, restaura y utiliza en forma racional, manteniendo los servicios de los ecosistemas, sosteniendo un planeta sano y brindando beneficios esenciales para todos”. A priori todos estamos de acuerdo con estos principios, pero pensemos que el 2050 está aún muy lejos, que la pérdida de biodiversidad es constante, que los recursos naturales son finitos y que necesitamos decisiones científicas, políticas y económicas urgentes y ambiciosas para cumplirlos.

Conclusión

La Naturaleza es resistente, pero sin un respiro para recuperar la pérdida de animales y plantas, los bosques extinguiéndose; los océanos contaminados, los suelos y ríos asfixiados por los agroquímicos y las costas invadidas por la urbanización, el Planeta no se podrá restablecer.

El director del Fondo Mundial para la Naturaleza, Jim Leape, dijo que a pesar de las limitaciones del acuerdo "éste reafirma la necesidad fundamental de conservar la naturaleza como la base de nuestra salud y nuestra economía. Los gobiernos han dado un fuerte mensaje de que proteger al planeta es un tema central de la política internacional".

Julia Marton-Lefèvre, Directora General de la UICN aseveró que: “Aquí en Japón, la comunidad internacional se acercó más a la comprensión de que es hora de dejar de considerar a la naturaleza como fungible y los gastos relacionados con su conservación como una pérdida - es hora de valorar y conservar la naturaleza”.


* Presidente / Asociación Amigos de los Parques Nacionales - AAPN -
   Experto Comisión Mundial de Áreas Protegidas - WCPA - de la UICN.
   Red Latinoamericana de Áreas Protegidas - RELAP -
   Miembro Comisión Cuenta Atrás 2010 - UICN -

Colabora con BioUnalm.

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Previniendo los efectos secundarios de la quimioterapia

Cuando a una persona le diagnostican algún tipo de cáncer, la principal forma de tratamiento es la quimioterapia. Sin dudas, todos saben que la quimio tiene efectos secundarios perjudiciales para la salud, desde los vómitos, pérdida de apetito, reducción del peso y defensa contra enfermedades, hasta la caída del pelo y daño a los órganos, tejidos y mucosas sanas de nuestro organismo.

Por ejemplo, la forma de tratar un cáncer de colon o tumores cerebrales y pulmonares es a través del uso del Irinotecan (conocido también como CPT-11), el cual es un derivado de la camptotecina y tiene una actividad inhibidora sobre la Topoisomerasa I, enzima encargada de desenrollar el ADN para que se pueda replicar. Esta enzima se encuentra muy activa en células de rápida división como lo son las células cancerígenas, por esta razón, este compuesto es usado como antineoplásico.

El CPT-11 es en realidad una pro-droga, o sea, necesita modificarse para volverse activo y poder ejercer su efecto anticancerígeno. EL CPT-11 es una molécula unida a un grupo funcional – dipiperidina – que le permite ser más soluble en nuestro organismo y capaz de ingresar a las células cancerígenas de manera más sencilla. Una vez dentro, este grupo funcional es liberado por acción de una enzima y el CPT-11 pasa a su forma activa SN-38. Una vez que ejerce su función sobre las topoisomerasas I, se va al hígado donde es modificado nuevamente. El SN-38 gana un grupo glucurónido pasando a SN-38G. Este grupo glucurónido ayuda a que la droga sea eliminada de nuestro organismo. El SN-38G es excretado al sistema gastrointestinal a través de los ductos biliares, para finalmente ser eliminados.

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Sin embargo, nuestra flora intestinal, la cual cumple un papel importante en el proceso digestivo y sin dudas son beneficiosas para nosotros, tiene la capacidad de usar el grupo glucurónido del SN-38G como fuente de carbono (alimento). A través del uso de su enzima β-glucuronidasa, remueve el grupo glucurónido de la SN-38G dejando libre a la SN-38. En los intestinos la SN-38 es tóxica! llegando a causar severos cuadros de diarreas y daños en la mucosa y el epitelio intestinal. Estos efectos secundarios restringe la cantidad de droga administrada y reduce su eficacia en el tratamiento del cáncer.

CPT-11

Una forma de reducir los efectos secundarios de esta droga es administrarlo junto a determinados antibióticos que maten los microbios que producen la β-glucuronidasa, de esta manera, ya no se forma el SN-38 en los intestinos. Pero, como estos microbios son esenciales para el buen funcionamiento de nuestro organismo, su muerte también nos podría traer serios inconvenientes. Por ejemplo, la flora intestinal nos protege de muchos microorganismos patógenos como la E. coli enterohemorrágica o el Clostridium difficile. Si matamos nuestra flora intestinal, nos veremos desprotegidos antes estas infecciones. Entonces, ¿qué podemos hacer?

Wallace et al. de la Universidad de Carolina del Norte, investigaron la forma de reducir los niveles de la β-glucuronidasa sin matar la flora intestinal. Sin dudas la mejor solución era a través de la búsqueda de inhibidores específicos de la β-glucuronidasa bacteriana. Como sólo se conocía la estructura de la β-glucuronidasa humana mas no la bacteriana, tuvieron que purificarla y mediante la técnica de cristalografía de rayos X determinar su estructura para así poder buscar moléculas que la inhiban.

glucuronidase_inhibLa estructura de la β-glucuronidasa bacteriana se diferenciaba de la humana en una horquilla (loop) de 17 aminoácidos en la región C-terminal, que es donde está ubicado el sitio activo de la enzima. Luego, usando un catálogo de 10240 compuestos diferentes, probaron uno por uno (high-throughput screening) para ver cuales tenían un efecto inhibidor sobre la β-glucuronidasa. De las 10240 moléculas probadas se quedaron solo con cuatro, ya que tenían una alta capacidad inhibidora con una baja concentración de dosis. Usando nuevamente la cristalografía de rayos X observaron que estos cuatro compuestos se unían a la horquilla de 17 aminoácidos, lo cual indicaba que los inhibidores eran específicos de la enzima bacteriana. Para corroborar este resultado, diseñaron una enzima bacteriana que no tenía esta horquilla de 17 residuos, y como era de esperarse, las cuatro moléculas inhibidoras no funcionaron.

Pero, para que pueda pasar la prueba, estos inhibidores no debían ser tóxicos ni para la flora intestinal ni para las células del tracto gastrointestinal. Como el 99% de las bacterias de nuestra flora intestinal son anaerobias obligadas, se probó la toxicidad de estos compuestos en E. coli cultivadas de manera anaeróbica. Los resultados fueron muy buenos ya que no se observó toxicidad sobre las E. coli  ni otras bacterias intestinales como Bifidobacterium infantis y Lactobacillus reuteri. Al hacer el ensayo con líneas celulares humanas, tampoco encontraron ningún nivel de citotoxicidad en estas células.

CPT-11ToxicityIFinalmente, compararon los cuadros de diarrea usando la CPT-11 sola y la CPT-11 con cada uno de los cuatro inhibidores de la β-glucuronidasa bacteriana. Los ratones que recibieron la droga más el inhibidor redujeron los cuadros de diarrea en más del 50%, sin dudas un resultado muy alentador. Además, al analizar el tejido epitelial gastrointestinal de los ratones observaron que tampoco habían sufrido daño alguno.

Sin dudas, este trabajo trae muchas esperanzas para mejorar el tratamiento del cáncer mediante la quimioterapia, claro que faltan hacer estudios farmacocinéticas y citotóxicos en humanos, pero de funcionar, se podría aumentar las dosis de CPT-11 que se le administra a los pacientes, mejorando su efecto antineoplásico y evitando los famosos efectos secundarios del tratamiento.

Referencia:

ResearchBlogging.orgWallace, B., Wang, H., Lane, K., Scott, J., Orans, J., Koo, J., Venkatesh, M., Jobin, C., Yeh, L., Mani, S., & Redinbo, M. (2010). Alleviating Cancer Drug Toxicity by Inhibiting a Bacterial Enzyme Science, 330 (6005), 831-835 DOI: 10.1126/science.1191175

06 noviembre, 2010

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Cómo desensamblar una lagartija?

Llegó el fin de semana, aquí comparto con ustedes este video asombroso de como una lagartija es desmantelada por completo. Si quieren obtener el esqueleto de un animal para algún trabajo de zoología, esta es la mejor forma de hacerlo.

Y así como se desarma, porque no ponerlo en reversa y ver como se arma una lagartija usando pequeñas hormigas… sería como Lego® herpetológico!

Vía The Gleaming Retort.

05 noviembre, 2010

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Si las películas de ciencia ficción tuvieran más ciencia real…

Muy buena ilustración de Jorge Cham que nos muestra algo real… si las películas de ciencia fueran realmente científicas, serían mucho más aburridas, menos dramáticas, y menos llamativas, sería como… documentales.

Personalmente, me gustan mucho las películas de ciencia ficción o las que se basan en algo “científico”, porque me gusta ver las incoherencias que se dicen para darle una trama a la historia, obviamente, la mayoría no se dará cuenta de ello y ni les interesará averiguar la base científica de la película que vieron, ya que van a ver una película es para divertirse y relajarse y no para estar preocupado y renegar porque lo que dicen no es científicamente o estadísticamente posible.

Por ejemplo, en Transformers, cuando los policías van a la casa de Sam con un detector de radiación, buscando si hubo contacto con los Autobots, monitorean a Sam Witwiki y ven que el detector marca 500 Rads!. En primer lugar, los Rads mide la cantidad de dosis radiactiva absorbida por un cuerpo. Rad era una medida antigua – aunque aún sigue usándose en EEUU – pero, para el sistema internacional de unidades (SI), la medida oficial es el Gray (Gy) el cual equivale a 100 Rads, así que haciendo la conversión, Sam Witwiki recibió una dosis de 5Gy. Pero, para darle una significancia biológica, se multiplica por un factor de eficacia biológica (cuanto más perjudicial es la radiación, mayor será el valor). Como los Autobots tienen otra composición isotópica de los metales que los conforman, liberarán radiación en forma de rayos gamma y partículas beta, y su eficacia biológica es 1. Al multiplicar los Gy por este factor se transforman en Sievert (Sv). Entonces, Sam Witwiki habrá recibido 5Sv de radiación, y según la tabla de niveles de exposición a la radiación y síntomas, Sam tendrá un envenenamiento agudo por radiación y es muy probable (>75%) que muera en los próximos 30 días, aunque los síntomas empezarían a las 2 horas de haberse expuesto a la radiación. Y en segundo lugar, ese equipo de detección de radiación no mide la tasa de dosis absorbida sino emitida en un determinado tiempo. Esto quiere decir que Sam Witwiki se ha contaminado radiactivamente, y si la lectura del monitor ha sido directa, esto quiere decir que Sam esta emitiendo 5Sv/hr, lo cual es sumamente grave ya que toda persona que esté cerca a él recibirá 5Sv de dosis en 1 hora, o sea, se envenenará. Conclusión: No es bueno que los Autobots estén en la Tierra.

Otro ejemplo que recuerdo es de la película Evolution con David Duchovny. Esta trata de un meteorito que cae en la Tierra portando vida extraterrestre, la cual evoluciona rápidamente, desde simples microorganismos hasta complejos dinosaurios y reptiles. Según la película, estos organismos están compuestos de Nitrógeno!, pero también tienen ADN. Como van a tener ADN si están compuestos de Nitrógeno? El nitrógeno solo puede formar tres enlaces y no cuatro como el carbono, así que las opciones para formar estructuras más complejas es menor. Y por si fuera poco, su ADN en base al nitrógeno, cuenta con 10 nucleótidos diferentes!. Entonces su estructura del ADN será diferente, ya no en forma de hélice como la conocemos, pero NO, en la película, su ADN también tiene esa forma. Y la cantinflada final, según la ubicación de los elementos en la tabla periódica, el veneno de una vida basada en el Nitrógeno sería el Selenio, ya que para nosotros que estamos basados en el Carbono es el Arsénico. Conclusión: Si nos invaden extraterrestres con biomoléculas basadas en el Nitrógeno, usemos Head & Shoulders para aniquilarlos, tal como lo hacemos con la caspa.

selenio

Otro ejemplo, aunque este me parece el más plausible de todos se da en La Guerra de los Mundos, donde son los microorganismos quienes nos salvan de una exterminio asegurado. Creo yo que si algún día somos invadidos por seres de otros planetas, obviamente serán mucho más avanzados que nosotros, así que nuestras insignificantes armas no les harán ni cosquillas, entonces, la mejor forma de combatirlos sería usando armas biológicas. Ya vimos que los microorganismos pueden crecer y vivir en los ambientes más raros y extremos del mundo, pueden degradar y usar como fuente de energía todo tipo de compuestos, así que sería una de las formas de combatirlos, siempre y cuando, su composición química elemental sea similar a la nuestra, basadas en el carbono.

En el Fin de los Tiempos de Night Shyamalan donde las plantas, en modo de respuesta a la actividad humana que ha perjudicado sus ecosistemas, liberan una neurotoxina que provoca que las personas se suiciden. Bueno, el hecho de que una toxina sea capaz de afectar nuestro sistema nervioso y activar mecanismos de autodestrucción podría ser cierto. Si hay muchas drogas que nos hacen exaltarnos y llenarnos de júbilo, por qué no otras que nos creen deseos de suicidarnos? Pero, para que todas las plantas liberen el mismo compuesto, debería tener el mismo gen, el cual debería estar regulado por los mismos factores de transcripción, y a parte deben tener estructuras complejas como glándulas o tejidos secretores similares para poder liberar esas sustancias, las cuales deben ser volátiles como los aromas de las flores, para poder ser diseminados con mayor facilidad. Pero, que todas las plantas compartan este mismo mecanismo de defensa es poco probable, a menos que todas esas plantas pertenezcan a grupos filogenéticamente relacionados.

Seguro que hay más, como Planeta Rojo, donde Marte se llenó de oxígeno en muy pocos años, con un poco de algas y líquenes escondidos en una región del planeta, o es el Núcleo, donde se construye una máquina capaz de soportar temperaturas que fundirían hasta el metal o la aleación más resistente o presiones que harían colapsar cualquier vehículo diseñado por el hombre. O en el día después de mañana donde la era de hielo como producto del calentamiento global llega en menos de 3 meses. En fin, a ver si Ustedes también nos comentan de algunas…

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Bio-Linux, sistema operativo ideal para el biólogo

La verdad, no sé mucho del sistema operativo basados en Linux, sólo se que es un software libre y que muchos científicos e investigadores los usan porque les permiten optimizar todos los recursos de la computadora para las tareas que quieren realizar, sobre todo en el área de la bioinformática. Los datos biológicos que cada día se generan son cuantiosos, empezando desde las secuencias de ADN y proteínas, más ahora que estamos en la era de las “ómicas” (genómica, proteómica, epigenómica, metabolómica, etc.); hasta estudios filogenético, biogeográficos y poblacionales. Esta cantidad de infromación ha creado la necesidad de desarrollar un sistema operativo que permita integrar todos estos datos de manera sencilla y que ponga en nuestras manos herramientas bioinformáticas capaces de analizarlos velozmente.

Fue así que en el año 2006 nació Bio-Linux, un sistema operativo diseñado para el biólogo de hoy, con una plataforma bioinformática muy útil que facilita la compartición de datos, con una fácil instalación y manejo, y con un bajo consumo de recursos de nuestro sistema, que ha permitido acelerar el trabajo de los programas bioinformáticos, los cuales se basan en complejos algoritmos que demandan la mayor parte de los recursos de nuestra computadora.

Este año se ha lanzado la versión 6.0, el cual se basa en una plataforma Ubuntu 10.04 (una de las mejores de Linux), y que contiene más de 500 programas bioinformáticos pre-instalados. Además cuenta con un gran soporte técnico on-line, que te ofrece una gran cantidad de muestras de datos para que puedas probar el funcionamiento de cada uno de los programas con que cuenta Bio-Linux. Bio-Linux es de fácil instalación, puede funcionar a la par con tu sistema operativo Windows o Mac OS X, así como también directamente desde tu USB o un DVD.

Si estas más especializado en la biología molecular, tal vez sea más adecuado para ti la plataforma DNALinux, el cual también tiene programas bioinformáticos pre-instalados como ApE- A Plasmid Editor, Biopython, Blast, Emboss, FinchTV, NCBI Toolkit, Polyxmass, primer3, entre otros.

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Sin dudas, para aquellos que se sienten cómodos manejando una plataforma Linux, esta es una gran herramienta, para los que no, no importa, a menos que quieras dedicarte a la bioinformática, donde manejar Linux es esencial.

Para descargar Bio-Linux 6.0: http://nebc.nerc.ac.uk/tools/bio-linux/bio-linux-6.0

Para descargar DNALinux: http://www.dnalinux.com/

Para descargar programas científicos para Linux: http://www.gentoo.org/

Referencia:

Field, D; et al. 2006. Open software for biologists: from famine to feast. Nature Biotechnology. 24: 801 – 803. doi: 10.1038/nbt0706-801

04 noviembre, 2010

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El sistema inmunológico de las bacterias II

Hace un par de meses describimos como funcionaba el sistema inmune de las bacterias por medio del sistema de agrupación de pequeñas regiones palindrómicas regularmente espaciadas, mas conocido como CRISPR (por sus siglas en inglés). En aquel artículo vimos la función de una de las proteínas cas, la cual está encargada de hacer el corte de las pequeñas secuencias de ARN derivadas del CRIPSR (ARNcr) para silenciar el ADN invasor, por ejemplo, de un fago.

El día de hoy se publicó en Nature algo más sobre este sistema. La forma básica de un sistema CRISPR esta conformado por pequeñas secuencias repetidas separadas por secuencias no repetidas llamadas espaciadores. Son estos espaciadores los responsables del reconocimiento del ADN foráneo ya que, si encuentran secuencias complementarias en el fago (proto-espaciadores), lo silenciarán  y protegerán a la bacteria de esta infección.

CRISPR

Si la bacteria es infectada por un fago para el cual no tiene un espaciador, la bacteria sucumbirá ante la infección y morirá. Pero, los investigadores observaron que un pequeño número de estas bacterias tiene la capacidad de “robar” pequeños fragmentos del ADN foráneo e insertarlo en su sistema CRISPR, convirtiéndolos en espaciadores y adquiriendo resistencia para futuras infecciones.

Una de las cosas interesantes que encontré en este trabajo fue que este sistema CRISPR también actúa sobre los plásmidos, regulando su número y estabilidad dentro de las bacterias. Los investigadores liderados por la Dra. Josiane Garneau de la Universidad de Laval en Québec, Canadá, usaron sepas de Streptococcus thermophilus, y observaron que el sistema CRISR/Cas actúa tanto sobre el ADN de hebra doble del plásmido como del fago. Pero, lo más sorprendente fue que habían cepas que eran parcialmente resistentes a los plásmidos y que podían acumular plásmidos de hebra simple, los cuales se perdían después de un número determinado de generaciones.

Los investigadores también encontraron dos genes cas relacionados con el sistema CRISPR. Cas5 estaba envuelto en la interferencia de los ARNcr con el ADN foráneo, mientras que cas7 estaba relacionado con la adquisición de espaciadores. Así que cuando se inactivaba el gen cas5 la bacteria restablecía su sensibilidad a los fagos y los plásmidos permanecía circulares. Cuando cas7 era inactivado, la bacteria era sensible a futuras infecciones por parte de los fagos pero sí tenía la capacidad de formar plásmidos lineares.

Los investigadores también determinaron la importancia de la orientación de los proto-espaciadores y la especificidad por las secuencias, especialmente del extremo 3’, ya que observaron que en el extremo 5’ no había complementariedad con la secuencia del espaciador, pero aún así no perdía su actividad de silenciar el ADN foráneo. Estos mecanismos ayudan a explicar también la carencia natural de plásmidos en las cepas de S. thermophilus.

Como podemos ver, el sistema CRISPR/Cas es de vital importancia para las bacterias ya que actúa como si fuera un sistema inmune, sin embargo, también vemos que puede afectar la adquisición de plásmidos, los cuales podría cargar genes de resistencia a antibióticos, los cales podrían también beneficiar al microorganismo.

Referencias:

ResearchBlogging.orgGarneau, J., Dupuis, M., Villion, M., Romero, D., Barrangou, R., Boyaval, P., Fremaux, C., Horvath, P., Magadán, A., & Moineau, S. (2010). The CRISPR/Cas bacterial immune system cleaves bacteriophage and plasmid DNA Nature, 468 (7320), 67-71 DOI: 10.1038/nature09523

Imagen: Sontheimer EJ & Marraffini LA. Slicer for DNA. doi: 10.1038/468045a